澡堂 偷拍 Quantitative Genetics in Plants
第一讲(9月18日)澡堂 偷拍
小序:数目遗传学发展简史、数目遗传学的辩论骨子和方法、数目遗传学的育种应用、数目遗传学发展标的、CIMMYT小麦育种简介、不雅看记录片《The Norman Borlaug Story》
[课件1-1;课件1-2] 澡堂 偷拍[课外功课1]
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第二讲(自学)
附录:线性代数和概率统计基础:矩阵和矩阵运算,立地变量(碎裂和逢迎),立地变量的概率密度函数和概率踱步函数,立地变量的数学渴望和方差,样本和样本统计量,参数揣摸的常用方法
[课件2] [课外功课2]
第三讲(9月25日)
第一章:育种群体的遗传构成:基因和基因型频率,改造基因和基因型频率的身分,自交和回交群体中基因和基因型频率的变化,立地交配群体中基因和基因型频率的变化,Hardy-Weinberg均衡定律和均衡的磨砺
第二章:影响群体遗传均衡的身分:移动和突变,接受,立地漂变
[课件3-第一章;课件3-第二章] [课外功课3]
第四讲(10月9日)
第三章:有用群体大小,群体遗传学在遗传资源保护中的应用;亲本关联和近交;亲本统共和近交统共的估算
[课件4-第三章] [课外功课4]
第五讲(10月16日)
第四章:双亲杂交后代的世代平均数和方差分析:数目遗传学的发展、基本骨子与辩论方法,基因作用的类型,加性—显性遗传模子,步调磨砺,非等位基因的互作(上位型互作),模子相助
实习1 借助关联野神思软件进一步意志群体遗传学:(1)立地交配群体中基因频率的变化;(2)遗传资源征集、保存和再生历程中的统计模子与模拟
[课件5] [课外功课5] [实习1材料]
第六讲(10月23日)
第五章:立地交配群体中遗传效应的领悟:基因平均效应,基因替代效应,育种值,显性离差,两个等位基因间的互作,上位性离差,等位基因的测交效应,单交组合中遗传效应的领悟;立地交配群体中遗传方差的领悟
实习2 六家系世代的平均数与方差分析:哄骗一套六家系世代数据(着实的或模拟的)揣摸遗传参数,并哄骗野神思模拟揣摸模子相助的统计功效
[课件6] [课外功课6] [实习2材料]
第七讲(10月30日)
第六章:遗传交配瞎想与遗传参数的揣摸:双亲本杂交瞎想,NC(North Carolina)I、II、III瞎想,TTC(triple test cross)瞎想,双列杂交瞎想,一般配协力和终点配协力分析
[课件7] [课外功课7] [实习3材料][方差分析和线性模子]
第八讲(11月6日)
第七章:基因型和环境互作:基因型和环境互作的类型澡堂 偷拍,互作方差的揣摸,品种巩固性分析,AMMI(additive main effects and multiplicative interaction
实习3 哄骗遗传交配瞎想估算遗传方差和遗传力:哄骗NCI、NCII和NCIII遗传交配瞎想揣摸遗传参数(哄骗田间数据或模拟数据,哄骗SAS软件)
[课件8] [课外功课8] [课堂锻真金不怕火材料]
第九讲(11月13日)
第八章:接受反应的估量与进步遗传进程的道路:接受的类型,遗传力和接受反应,关联性状的波折接受和多性状的同期接受:遗传关联和关联接受,接受指数
[课件9] [课外功课9] [课堂锻真金不怕火材料]
第十讲(自学)
第九章:羼杂遗传模子:羼杂踱步表面,极大似然揣摸,EM算法,一双和两对主基因的主基因遗传模子,多基因遗传模子,一双主基因和多基因的羼杂遗传,羼杂遗传模子野神思软件的使用
实习4 羼杂遗传模子分析方法的使用:对一组田间数据或模拟数据,哄骗羼杂遗传模子的分析方法细目其遗传方法
[课件10] [实习4材料]
第十一讲(11月20日)
QTL作念图(I):两个基因座位间重组率的揣摸(两点分析),三点分析,遗传干预和作念图函数,连锁图构建算法
实习5 QTL作图(I):QTL IciMapping软件的使用—连锁图谱的构建(MAP),图谱的整合(CMP),冗余记号处分(BIN)
[课件11] [课外功课10] [实习5材料QTL IciMapping软件] [netFramework] [EM算法锻真金不怕火]
第十二讲(11月27)
QTL作念图(II):基首肯趣,单点作图,粗浅区间作图
实习5 QTL作图(II):QTL IciMapping软件的使用—双亲群体QTL作图(BIP)
[课件12] [课外功课11-15]
第十三讲(12月4日)
QTL作念图(III):完备区间作图,F2群体的作图以偏激他QTL作图方法
实习5 QTL作图(III):QTL IciMapping软件的使用--CSSL群体的QTL作图(CSL)、QTL和环境互作(MET)、NAM群体(NAM)、奇异折柳(SDL)
[课件13]
第十四讲(12月11日)
第十五讲(12月19日)
QTL作念图(V):QTL检测功效的模拟和检测方法的相比
实习5 QTL作图(V):QTL IciMapping软件的使用—QTL检测功效的模拟和检测方法的相比
[课件15]
第十六讲(12月25日)
QTL作念图(VI):QTL作念图辩论中存在的问题和对策
实习5 QTL作图(VI):QTL IciMapping软件的使用—整个功能
[课件16]
育种模拟(与“育种专题”统一进行)
第十二章:育种模拟I:QuLine育种模拟要领的应用实例,基因和环境系统的缔造,骨子包括育种方针环境TPE(target population of environments),复等位基因,加性-显性-上位性基因效应,一因多效等;育种模拟II:育种方法的界说,骨子包括选育近(自)交系育种要领中自杂交到终试各个阶段的世代递进方法(系谱或羼杂),所接受性状(一个或多个),接受比例,接受类型(高值、中间值、低值或立地)等
实习6 与选育自交系关联的育种方法的模拟与相比:哄骗QuLine育种模拟软件界说遗传模子和接受决策,相比不同接受决策间的各异
[课件育种模拟] [实习6育种模拟软件] [课外功课-育种模拟]
期末测试(2015年1月8日)
课程得益评定:
通俗功课和实习叙述(6个中任选1个)占50分,期末测验占50分。
实习叙述从6个中任选1个,骨子包括实习倡导、所用数据和材料的粗浅态状、遵守分析和辩论,遵守最佳用图形或表格的体式表述出来。
6个供接受的实习题目如下:
实习1 借助关联野神思软件进一步意志群体遗传学:(1)立地交配群体中基因频率的变化;(2)遗传资源征集、保存和再生历程中的统计模子与模拟。
实习2 六家系世代的平均数与方差分析:哄骗一套六家系世代数据(着实的或模拟的)揣摸遗传参数,并哄骗野神思模拟揣摸模子相助的统计功效。
实习3 哄骗遗传交配瞎想估算遗传方差和遗传力:哄骗NCI、NCII和NCIII遗传交配瞎想揣摸遗传参数(哄骗田间数据或模拟数据,哄骗SAS软件)。
实习4 羼杂遗传模子分析方法的使用:对一组田间数据或模拟数据,哄骗羼杂遗传模子的分析方法细目其遗传方法。
实习5 QTL作图:哄骗QTL IciMapping软件了解连锁图谱的构建、QTL作念图的一般历程、作念图遵守分析。
实习6 与选育自交系关联的育种方法的模拟与相比:哄骗QuLine育种模拟软件界说遗传模子和接受决策,相比不同接受决策间的各异。